清朝地方官编制以总督和巡抚为最高的地方行政长官。巡抚是中国明清时地方军政大员之一。又称抚台，是巡视各地的军政、民政大臣。清代巡抚主管一省的军政、民政，以“巡行天下，抚军安民”而名，实际上巡抚只能巡视军务，并没有管理的权力。而对统辖一省或数省行政、经济及军事的长官称为总督，与只掌握一省行政事务的巡抚不同，总督兼管数省，同时在政务之外也兼掌军务与经济，也可参与管理地方事务。
封建官员们都讲究官阶，总督（通常兼任兵部尚书衔，方便管理地方军务）品阶为正二品，最高为从一品。巡抚（通常兼任兵部侍郎衔），品阶为从二品，最高可为正二品。而且从职责上来看，总督对巡抚有节制权力。虽然不是总督直接领导，但这“节制”一词就足够总督做点什么了。所以总督往往会不甘寂寞地干预地方政府的财政大权和军事大权。当然总督在官面上表示出发点都是为了大清王朝更好地向上发展，总督这一伸手，就能碰到巡抚及以下地方官员，到巡抚之下藩、臬两司的正三品官员身边。地方官员自然不敢直接同从一品的总督较量，只敢在明面上应付，背地里自有打算。总督的手伸得这么长，巡抚肯定会有意见。督抚之关系，可见一斑。
在战争年代，总督因官阶稍高，权力会更大一些。因为战时其实就是打仗，而总督是负责军事的，巡抚则不能管理军事。但是巡抚和总督无论谁的权力大小，双方并不能越过对方指挥下属，也不能指挥对方，双方依旧是平级的。
巡抚和总督各司其职，互相不干扰，但是既然是统辖一块地方，那么多多少少都会有些大大小小的摩擦。有了摩擦之后，小摩擦一般都是私下处理，大摩擦就是到皇帝面前参一本呗。如果是战争时期，清朝一般都会站在总督这边，巡抚要吃一点亏，而如果是和平年代，那就是让总督吃一点亏，巡抚占一点便宜。两者之间实际上一直没有谁的权力大于谁，都是同一级的，在地方事务上各司其职。
