司机在上班时间出车，出现交通事故，报了保险，保险公司赔偿后剩下的部分差额应该由公司还是当事司机承担

Answer 1

这个问题不好说。看你的表述大概是司机上班时间出车公干，出了交通事故，并付主要责任。
这种情况下，如果起诉，你和公司都是被告，要承担连带责任，换句话说就是原告即可以向你要钱也可以向公司要钱。不过，正常的话，原告都会找公司要钱的（毕竟公司比你有钱），这样这个案子也就算结束了。
之后就是你和公司之间的债务关系了。如果你当时签的合同有明文规定的话，按规定执行吧。即使是责任认定有所偏颇，但由于你签字了，代表你认定了，合同的有效性，你也要承担责任。如果，没有明确规定，那公司没有权利就这个赔偿案件要求你独立进行支付。但，公司有权向仲裁机构要求你进行赔偿公司的营运损失（这一般指的是车被扣，或是给公司造成了不良影响）。

Answer 2

司机在上班时间的活动是职务行为，所以这部分差额应由公司支付。
但是，如果公司和司机本人另有约定的情况除外。

Answer 3

应该由公司承担。

Answer 4

应该公司承担。