区位 南京位于长江下游中部地区，江苏省西南部，是国家区域中心城市（华东），长三角辐射带动中西部地区发展的国家重要门户城市，也是“一带一路”战略与长江经济带战略交汇的节点城市。 地理坐标为北纬31°14″至32°37″，东经118°22″至119°14″。 市中心新街口地理坐标为北纬32°02'38、东经118°46'43。 总面积6597km²（不含水域），截至2012年建成区面积752.83km²。 地貌 南京山水城林融为一体，江河湖泉相得益彰。长江穿城而过，沿江岸线总长近200公里。紫金山风景绝佳，幕府山气势雄伟，秦淮河、金川河萦绕其间，玄武湖、莫愁湖、百家湖点缀其中，较大的湖泊有石臼湖、固城湖、金牛湖等湖泊，水域面积占总面积的11%以上，林木覆盖率26.4%，建成区绿化覆盖率45%，人均公共绿地面积13.7平方米，位居中国前三甲，是中国四大园林城市，联合国人居署特别荣誉奖获得城市。
南京市平面位置南北长、东西窄，成正南北向；南北直线距离150公里，中部东西宽50～70公里，南北两端东西宽约30公里。南面是低山、岗地、河谷平原、滨湖平原和沿江河地等地形单元构成的地貌综合体。 气候 南京属亚热带季风气候，雨量充沛，年降水1200毫米，四季分明，年平均温度15.4°C，年极端气温最高39.7°C，最低-13.1°C，年平均降水量1106毫米。春季风和日丽；梅雨时节，又阴雨绵绵；夏季炎热，秋天干燥凉爽；冬季寒冷、干燥。
南京春秋短、冬夏长，冬夏温差显著，四季各有特色，皆宜旅游。因此就有了“春游牛首烟岚”、“夏赏钟阜晴云”、“秋登栖霞胜境”、“冬观石城霁雪”之说，由于大气环流的变化以及南京不断的植树造林，南京夏天的炎热程度与江南、华南其他都市相比大为减轻，故有为南京摘去“火炉”帽子的说法。 资源 南京地处北亚热带，属于中国现代植物资源最丰富、植物种类最繁多的地区。又以山丘、河湖兼备，气候温和，而野生动物资源丰富繁多，其动物种类，足以代表长江下游地区。野生动物资源丰富，栖息、繁衍的国家级保护动物有中华鲟、白鳍豚、扬子鳄、河鹿、江豚、鸳鸯、长耳鹗、短耳鹗等。
南京蕴藏着较丰富的矿产资源，境内已发现54种矿藏。铁、铜、铝、锌、金、银、锶等15种矿储量江苏第一，4种进入中国前6位。其中，铁硫储量占全省40%左右，锶矿品位高、储量大，为东南亚之首。地下水源丰富，水质优良，温泉是南京主要的地热资源，著名的有汤山温泉、汤泉温泉、珍珠泉温泉等。
